この記事ですが。
ソースコード20万行の大規模サイトのPHPを5.1から5.4に上げるためにやったことまとめ
お疲れ様でした。なかなかできないことです。
以前私もBtoBのASPでPHP4系から5系に上げるプロジェクトに参加したことがあります。このときは、PHPのセーフモードに依存しているコードを削除していく作業だったのですが、5人でフルに修正して半年かかり断念しました。稼働中ということもあったのですが、諦めて新プロダクトにリプレイスしたのです。
よほど拡張性を意識したコードでなければ、デグレートの危険が常につきまといます。
運用を考慮したソースを書きたいものです。